Après votre rêve, vous vous réveillerez sur le Normandy. S'en suivra quelques échanges avec Liara, Traynor, IDA, Hackett.
Allez vers la carte de la galaxie où Traynor vous parlera d'un laboratoire de Cerberus. Elle vous débloquera une quête annexe qui s'affichera sur votre carte de la galaxie : N7 : laboratoire de Cerberus. Libre à vous de vous y rendre de suite, ou de passer directement à la quête principale.
Si vous consultez votre terminal privé, vous pourrez lire en autre un message intitulé "Une amélioration vous attend" envoyé par Glyphe, qui vous annonce qu'une amélioration est disponible dans le bureau de Liara (Pont résidentiel N°3).
Pour poursuivre votre mission principale, allez à la carte de la galaxie et rejoignez Ménaé dans le système Trébia, secteur Crête apienne.

Eliminez les quelqueszombis qui sont à la sortie de la navette. Rejoignez la base des Turiens et allez parler au Général Corinthus. Il vous chargera d'aller réparer la tour de transmission.
La tour se trouve au fond à gauche du camp. Quelques vagues de zombis vous attendrons. Choisissez l'un de vos coéquipiers pour réparer la tour pendant que de nouveaux zombis vont arriver. Une fois la tour réparée, retournez au camp.

A votre retour, vous ferez vos retrouvailles avec Garrus. Le successeur du primarque est identifié, mais les ennemis sont encore à vos portes. Allez à l'astrodome pour affronter quelques Maraudeurs et zombis. Une fois la zone sécurisée, retournez au camp pour apprendre que la barricade a besoin de soutient. Montez sur la barricade nord, prenez la tourelle, et descendez tout ce qui bouge. Au bout d'un moment, vous allez faire face à votre première brute. Une fois le mastodonte à terre, Corinthus va vous donner les coordonnées du primarque Victus.

Suivez votre boussole jusqu'à rejoindre le primarque. Vous arriverez dans son camp où vous affronterez de nombreux cannibales, maraudeurs, et même trois brutes. Vous trouverez au sol une étoile noire de maraudeur pour vous aider à mettre ces monstres. Une fois que vous serez plus tranquille, discutez avec le primarque Victus qui vous comprendre que pour bénéficier de l'aide Turiens, vous devrez convaincre les Krogans de vous aider.

En retournant sur le Normandy, vous constaterez une baisse d'énergie, suivis d'un appel de Joker vous disant qu'il a perdu le contact avec IDA et vous demandant d'aller voir sur le pont 3. Allez au pont, dans la zone du noyau IA, pour découvrir qu'IDA a pris possession du corps du Docteur Eva. IDA sera désormais représentée sous cette forme, et pourra même vous accompagner sur les missions en tant que co-équipier. Sur le normandy, IDA sera désormais au coté de Joker dans le cockpit.
{C}Retournez sur la passerelle et discutez avec Traynor qui va vous parler de l'Académie Grisson et débloquer la mission Académie Grissom : l'enquête. Libre à vous de lancer cette mission ou de poursuivre la mission principale sur Sur'Kesh.
Si vous consultez vos messages sur votre terminal privé, vous remarquerez plusieurs messages qui vous encouragent à aller vers la Citadelle pour rencontrer :
- Thane Krios
- Le spectre Galarien Jondum Bau : débloque la mission Citadelle : diplomate hanari
- Miranda Lawson
- Ashley - la visite de l'hopital débloquera les missions Citadelle : interfaces d'ampli biotique, Citadelle : formule médi-gel pour extraterrestre et Frontière d'Ismar : composants de prototype
- Aria : débloquera les missions Aria : Berserkers, Aria : Soleils Bleus, Aria : Eclipse. La visite du purgatoire débloquera les missions Citadelle : réseau électrique supérieur, et Crête apienne : bannière du 1er régiment
Ce sont toutes des missions secondaires, donc à vous de voir si vous concentrez sur la mission principale (Priorité : Sur'Kesh) ou si vous faites un détour par la Citadelle.